光宗即位，朱熹知漳州，后改知潭州（湖南长沙）。宁宗即位，在赵汝愚推荐下，召朱熹为焕章阁待制，侍讲，朱熹推辞，朝廷不许。朱熹面圣后面辞，宁宗道：“爱卿经术渊源，正符合待制、侍讲之职，就不要推辞了，辜负了朕崇儒重道的本意！”宁宗话说这份上，朱熹就不好意思再辞了。

当初宁宗即位，韩侂胄有大功，朱熹多次提醒宁宗，谨防韩侂胄用权害政。仅仅四十多天后，宁宗在韩侂胄的怂恿下，直接御批朱熹为“祠禄官”。朱熹想以疾病为由退休，逃出是非之地，宁宗不同意。

不久，韩侂胄当权，朱熹苦日子也就来临了。不久相继发生“庆元党禁”，朱熹为了自己完成最后着作，咬牙承认了部分罪责，名声一落千丈，这事以后再细讲。朱子门人或遭流放，或被下狱，被整得七零八落。

公元1198年，朱熹以年近七十，提出退休，第二年，宁宗批准同意。公元1200年，七十一岁的朱熹在持续的“庆元党禁”中逝世。

公元1202年，宁宗下诏：“朱熹已经退休，拜授华文阁待制，赐予退休恩泽。”韩侂胄死后，又下诏赐予朱熹遗表恩泽。公元1210年，宁宗赐朱熹谥号为“文”。不久赠中大夫，特赠宝谟阁直学士。

公元1227年，朝廷赠朱熹太师，追封信国公，后改封徽国公。

公元1241年正月，朱熹与周敦颐、张载、程颐、程颢享祀孔子庙，被后世尊称为朱子。他的理学思想，成为元、明、清三朝的官方统治思想。

朱熹着述甚多，有《周易本义》、《周易启蒙》、《四书章句集注》《太极图说解》《通书解说》、《楚辞集注》等。其中《四书章句集注》成为后世钦定的教科书和科举考试的标准。

佐料：宋朝官职中，有“宝谟阁”直学士，“华文阁”待制，“焕章阁”学士等，这些是什么官职，怎么有这么多阁？对此《宋史.职官二》有详细介绍。

诸阁“学士”、“直学士”、“待制”是宋朝百官之外，另外加封的官职名称，为的是激励有品行道义和有文学才能的人。“学士”、“直学士”作皇帝顾问；“待制”参与论事，负责校勘文书，几乎没有实际职事。但职位却很荣耀，对他们的挑选要求也很苛刻。

宋代有龙图阁（太宗）、天章阁（真宗）、宝文阁（仁宗、英宗）、显谟阁（神宗）、徽猷阁（哲宗）、敷文阁（徽宗）、焕章阁（高宗）、华文阁（孝宗）、宝谟阁（光宗）、宝章阁（宁宗）、显文阁（理宗），各阁分别收藏括号里各皇帝的御制、御书、御集、圣制、宝瑞等。

各阁置“学士”、“直学士”、“待制”等官，唯有天章阁另设“侍讲”。“学士”为正三品，“直学士”为从三品，“待制”为从四品，“侍讲”为正七品。